Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1U1

Cog4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog4Q8R1U1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog4Q8R1U1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog4Q8R1U1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cog4Q8R1U1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cog4Q8R1U1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms