Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudcd3Q8R1N4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd3Q8R1N4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudcd3Q8R1N4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd3Q8R1N4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nudcd3Q8R1N4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms