Protein–RNA interactions for Protein: Q8R089

Fbrs, Probable fibrosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FbrsQ8R089 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FbrsQ8R089 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FbrsQ8R089 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FbrsQ8R089 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FbrsQ8R089 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FbrsQ8R089 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FbrsQ8R089 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
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FbrsQ8R089 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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FbrsQ8R089 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FbrsQ8R089 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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FbrsQ8R089 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FbrsQ8R089 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FbrsQ8R089 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FbrsQ8R089 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FbrsQ8R089 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FbrsQ8R089 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FbrsQ8R089 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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FbrsQ8R089 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FbrsQ8R089 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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FbrsQ8R089 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FbrsQ8R089 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms