Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZW7

Gabrp, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrpQ8QZW7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GabrpQ8QZW7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabrpQ8QZW7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GabrpQ8QZW7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GabrpQ8QZW7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GabrpQ8QZW7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GabrpQ8QZW7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GabrpQ8QZW7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.4 ms