Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolbQ8K409 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PolbQ8K409 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolbQ8K409 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PolbQ8K409 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PolbQ8K409 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PolbQ8K409 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PolbQ8K409 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PolbQ8K409 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PolbQ8K409 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms