Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mrpl47Q8K2Y7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mrpl47Q8K2Y7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl47Q8K2Y7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl47Q8K2Y7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl47Q8K2Y7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms