Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hacd3Q8K2C9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hacd3Q8K2C9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hacd3Q8K2C9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hacd3Q8K2C9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms