Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Colgalt1Q8K297 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Colgalt1Q8K297 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Colgalt1Q8K297 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Colgalt1Q8K297 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Colgalt1Q8K297 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt1Q8K297 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Colgalt1Q8K297 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Colgalt1Q8K297 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Colgalt1Q8K297 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Colgalt1Q8K297 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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