Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip10Q8CJ53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip10Q8CJ53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trip10Q8CJ53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip10Q8CJ53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trip10Q8CJ53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trip10Q8CJ53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trip10Q8CJ53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms