Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam20aQ8CID3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam20aQ8CID3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Fam20aQ8CID3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam20aQ8CID3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam20aQ8CID3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms