Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec10Q8CF98 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colec10Q8CF98 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Colec10Q8CF98 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec10Q8CF98 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colec10Q8CF98 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms