Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phf20l1Q8CCJ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Phf20l1Q8CCJ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Phf20l1Q8CCJ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Phf20l1Q8CCJ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phf20l1Q8CCJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms