Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8C5C9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8C5C9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8C5C9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8C5C9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8C5C9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8C5C9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8C5C9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8C5C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C5C9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8C5C9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8C5C9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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