Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gpcpd1Q8C0L9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpcpd1Q8C0L9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpcpd1Q8C0L9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpcpd1Q8C0L9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpcpd1Q8C0L9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gpcpd1Q8C0L9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpcpd1Q8C0L9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gpcpd1Q8C0L9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gpcpd1Q8C0L9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpcpd1Q8C0L9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpcpd1Q8C0L9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpcpd1Q8C0L9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpcpd1Q8C0L9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpcpd1Q8C0L9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms