Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg16l1Q8C0J2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg16l1Q8C0J2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms