Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx16Q8C080 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx16Q8C080 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx16Q8C080 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx16Q8C080 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx16Q8C080 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms