Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdsp2Q8BX07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdsp2Q8BX07 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdsp2Q8BX07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdsp2Q8BX07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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