Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Triml1Q8BVP1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Triml1Q8BVP1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Triml1Q8BVP1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Triml1Q8BVP1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Triml1Q8BVP1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Triml1Q8BVP1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms