Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcl3Q8BVF2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcl3Q8BVF2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcl3Q8BVF2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms