Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRK8

Prkaa2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa2Q8BRK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkaa2Q8BRK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkaa2Q8BRK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkaa2Q8BRK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkaa2Q8BRK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkaa2Q8BRK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms