Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Usp54Q8BL06 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Usp54Q8BL06 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Usp54Q8BL06 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Usp54Q8BL06 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Usp54Q8BL06 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Usp54Q8BL06 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp54Q8BL06 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms