Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chmp2bQ8BJF9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp2bQ8BJF9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp2bQ8BJF9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chmp2bQ8BJF9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp2bQ8BJF9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2bQ8BJF9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2bQ8BJF9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2bQ8BJF9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2bQ8BJF9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2bQ8BJF9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2bQ8BJF9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2bQ8BJF9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms