Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Prune1Q8BIW1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prune1Q8BIW1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Prune1Q8BIW1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prune1Q8BIW1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Prune1Q8BIW1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prune1Q8BIW1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms