Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
D130040H23RikQ8BII3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D130040H23RikQ8BII3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D130040H23RikQ8BII3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
D130040H23RikQ8BII3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
D130040H23RikQ8BII3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
D130040H23RikQ8BII3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
D130040H23RikQ8BII3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
D130040H23RikQ8BII3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
D130040H23RikQ8BII3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms