Protein–RNA interactions for Protein: Q80YQ8

Rmnd5a, Protein RMD5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmnd5aQ80YQ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rmnd5aQ80YQ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rmnd5aQ80YQ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rmnd5aQ80YQ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rmnd5aQ80YQ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms