Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rims3Q80U57 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rims3Q80U57 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rims3Q80U57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims3Q80U57 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rims3Q80U57 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms