Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4b1Q7TS58 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clec4b1Q7TS58 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec4b1Q7TS58 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4b1Q7TS58 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clec4b1Q7TS58 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms