Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcg2Q7TMS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Abcg2Q7TMS5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Abcg2Q7TMS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg2Q7TMS5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms