Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sox11Q7M6Y2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox11Q7M6Y2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox11Q7M6Y2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sox11Q7M6Y2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sox11Q7M6Y2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sox11Q7M6Y2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox11Q7M6Y2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox11Q7M6Y2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sox11Q7M6Y2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox11Q7M6Y2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms