Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21,02■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
ScocQ78YZ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,98■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20,98■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,96■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
ScocQ78YZ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20,94■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
ScocQ78YZ6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20,87■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20,86■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,85■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
ScocQ78YZ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
ScocQ78YZ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
ScocQ78YZ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
ScocQ78YZ6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
ScocQ78YZ6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20,83■□□□□ 0,92
ScocQ78YZ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
ScocQ78YZ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
ScocQ78YZ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,3 ms