Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eci3Q78JN3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eci3Q78JN3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Eci3Q78JN3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eci3Q78JN3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms