Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mvb12aQ78HU3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mvb12aQ78HU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mvb12aQ78HU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mvb12aQ78HU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mvb12aQ78HU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms