Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syne2Q6ZWQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms