Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnt1Q6ZPR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnt1Q6ZPR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms