Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tlr13Q6R5N8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr13Q6R5N8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tlr13Q6R5N8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr13Q6R5N8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms