Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sort1Q6PHU5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sort1Q6PHU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sort1Q6PHU5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sort1Q6PHU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sort1Q6PHU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms