Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Med16Q6PGF3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med16Q6PGF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med16Q6PGF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med16Q6PGF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms