Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Fchsd1Q6PFY1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd1Q6PFY1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd1Q6PFY1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd1Q6PFY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fchsd1Q6PFY1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fchsd1Q6PFY1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fchsd1Q6PFY1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fchsd1Q6PFY1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Fchsd1Q6PFY1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms