Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp49Q6P9L4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp49Q6P9L4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp49Q6P9L4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp49Q6P9L4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp49Q6P9L4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms