Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atg2aQ6P4T0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg2aQ6P4T0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg2aQ6P4T0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg2aQ6P4T0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg2aQ6P4T0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms