Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpbp1l1Q6NZP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpbp1l1Q6NZP2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms