Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sohlh1Q6IUP1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sohlh1Q6IUP1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sohlh1Q6IUP1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sohlh1Q6IUP1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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