Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt42Q6IFX2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt42Q6IFX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt42Q6IFX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt42Q6IFX2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms