Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud6aQ6IE21 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud6aQ6IE21 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otud6aQ6IE21 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud6aQ6IE21 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms