Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q6DFW0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q6DFW0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q6DFW0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q6DFW0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q6DFW0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q6DFW0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q6DFW0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q6DFW0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q6DFW0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6DFW0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q6DFW0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q6DFW0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q6DFW0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6DFW0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms