Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ablim3Q69ZX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ablim3Q69ZX8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ablim3Q69ZX8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ablim3Q69ZX8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ablim3Q69ZX8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ablim3Q69ZX8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ablim3Q69ZX8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms