Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrcc1Q69ZB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrcc1Q69ZB0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrcc1Q69ZB0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms