Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sptbn2Q68FG2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sptbn2Q68FG2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptbn2Q68FG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sptbn2Q68FG2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms