Protein–RNA interactions for Protein: Q64700

Rbl2, Retinoblastoma-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbl2Q64700 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rbl2Q64700 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbl2Q64700 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbl2Q64700 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbl2Q64700 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbl2Q64700 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rbl2Q64700 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbl2Q64700 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms