Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprdQ64487 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprdQ64487 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprdQ64487 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprdQ64487 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms